甘肃民勤连古城国家级自然保护区管理局从荒漠植被恢复重建技术研究、林业有害生物防治、生物多样性保护与可持续发展等10个方面开展基础性科学研究，共申报争取、合作开展、自列启动各类科研课题15项，先后获得甘肃省科技进步二等奖2项、武威市科技进步二等奖1项、国家梁希林业科学技术三等奖1项、甘肃省林业科技进步二等奖1项、甘肃省林业科技进步三等奖2项；获实用新型专利10项，制订甘肃省地方技术标准4项，保护区管理局专业技术人员先后在各类学术刊物发表科技论文100余篇。制定激励措施，鼓励专业技术人员积极参加学历教育和科研工作，提升了学历水平和职称层次。全区上下先后有3人（次）取得了正高级职称，22人（次）取得了高级职称、32人（次）取得了中级职称，58人（次）取得了初级职称，人才和科研队伍不断壮大。加强与科研院所和大专院校的科研合作，培育人才，积累经验，不断提高自身的科研实力和水平。进一步完善了科研基础条件，筹建了实验室及动植物标本室，结合科研工作，共采集制作植物标本140多种、900多份，昆虫标本170多种、2360份，采集整理病虫害标本80多份。 2012年和2017年，保护区被中国林学会授予第三批、第四批全国林业科普基地称号，同时被甘肃省科学技术协会命名为甘肃省科普教育基地。